In einer nahen Zukunft taucht plötzlich ein bedrohlicher roter Stern am Himmel auf, der das Ende allen irdischen Lebens einleitet. Die vereinte Regierung plant eine Evakuierung, doch für dieses scheinbar unmögliche Unterfangen werden die genetisch modifizierten Supermenschen namens Felix erschaffen. Unter ihnen ist Sion, die begabteste von ihnen, die seit einem Jahrhundert auf einer einsamen Insel gefangen ist. Ryou Haruna, ein Soldat der Regierung, wird zu ihrer Bewachung abkommandiert, während Sion nach Freiheit strebt. So beginnt die letzte Liebesgeschichte der Erde. Eden erzählt diese bewegende Geschichte mit der charakteristischen, hochgelobten Illustration von minori, fesselnden musikalischen Kompositionen und einem talentierten Team, das Fans immer wieder begeistert. Im Gegensatz zu herkömmlichen Visual Novels setzt Eden auf eine filmische Erzählweise mit fast ausschließlichen Event-Illustrationen. In einer Bildschirmauflösung von 1024 x 640 bietet das Spiel ein Erlebnis, das eher an einen Film als an ein Buch erinnert.
