Muv-Luv Alternative: Total Eclipse Remastered versetzt Sie ins Jahr 1973, als die Erde von den BETA, einer fremden Spezies, angegriffen wird. Diese übermächtigen Gegner haben bereits weite Teile Eurasiens erobert, und es ist nur eine Frage der Zeit, bis der Rest der Welt fällt. Die letzten Hoffnungen der Menschheit liegen in den Tactical Surface Fighters, mächtigen humanoiden Maschinen, die sich dem Feind entgegenstellen können. Im Mai 2001 werden Sie als Yuuya Bridges, ein eigenwilliger amerikanischer Testpilot, nach Yukon Base in Alaska versetzt. Hier arbeiten Sie an Projekt Prominence, einer internationalen Initiative zur Entwicklung neuer TSFs. Ihre Aufgabe ist es, gemeinsam mit einem japanischen Forschungsteam einen fortschrittlichen Jäger für das Japanische Kaiserreich zu entwickeln. Doch Ihr ungestümes Verhalten sorgt für Konflikte, besonders mit Ihrer strengen Vorgesetzten, Lieutenant Takamura Yui. Yui, die einzige Überlebende ihrer Einheit nach einem verheerenden Angriff, ist von ihrer Mission besessen. Ihre strikte Haltung und Ihr rebellischer Charakter führen zu ständigen Auseinandersetzungen, die das gesamte Projekt gefährden. Hinzu kommt, dass die Basis von internationalen Intrigen durchzogen ist, da jede Nation versucht, die Geheimnisse der anderen zu stehlen. Können Sie Ihre Differenzen mit Yui überwinden und die Waffe entwickeln, die die BETA-Bedrohung ein für alle Mal beenden wird?
